中国农工民主党上海交大支部是农工党上海市委的直属支部。最早成员是1953年2月加入农工民主党的李泰云。1957年三校合并时，张祖錩将组织关系由南洋工学院转到交大。1984年发展到7位党员，成立了党小组。
1987年12月-1989年，经农工市委批准成立第一届交大支部，主任为谢锦生，副主任为冯泽华。
1990年-1992年，第二届交大支部成立，主任为谢锦生，副主任为冯泽华。
1993年，第三届交大支部成立，主任为谢锦生，副主任为冯泽华。
2000年在12月26日，农工党上海市委九届十四次全会上，支部主委姚俭建被增选为市委常委、副主任委员。2000年支部党员共30人。
2005年10月26日下午，农工党上海交大第七届支部委员会成立，主委黄林鹏，副主委蔡骏，委员李啸虎、刘萍、邵华。
2010年10月18日，成立农工党上海交通大学第一届委员会，主委赵立平，副主委蔡骏、黄林鹏、粟莹，委员刘萍、邵华、杨燕华。
2011年，蔡骏当选为农工党闵行区委副主委。
2016年6月，中国农工民主党上海交通大学第二次党员大会召开，韩泽广当选为农工党上海交大第二届委员会主任委员，黄林鹏、蔡骏、粟莹当选为副主任委员，吴芸茜、钱昆、左开井当选为委员。
2021年7月，中国农工民主党上海交通大学第三次党员大会召开，韩泽广当选为农工党上海交大第三届委员会主任委员，钱昆、左开井、张玉梅当选为副主任委员，蔡宇伽、张峻当选为委员。